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HER2 基因的生物信息学分析

摘要 : 对 HER2 基因进行生物学功能和特性系统的进行生物信息学分析,了解其在分子水平的特征。方法:对于 NCBI 获取的 HER2 基因,利用 EMBOSS 本地软件对该基因 核苷酸序列进行组成成分及译得的氨基酸序列利用 emboss 以及一些在线工具进行理化性质分析。基于蛋白质序列利用 blastp 进行同源基因搜索,并利用 MEGA 进行系统进行分析。 结果:分析可知该基因 cg 碱基含量高,双螺旋结构稳定密码子有一定的偏好性,为今后导入载体选择进行研究提供了依据。基因编码的蛋白质二级结构含有 12 个跨膜螺旋,该蛋 白主要定位在膜上包括整体膜蛋白、内质网、溶酶体、核上。更加说明 HER2 原癌基因编码的跨膜糖蛋白,能启动信号转导系统的原因。进化分析显示该基因较为保守。

  • 作者 : 李颖慧
  • 作者单位 : 重庆邮电大学生物信息学院 重庆 400065
  • 关键字 : 乳腺癌;HER2;生物信息学分析
  • 刊名 : 健康忠告
  • 年,卷(期) : 2020 , 21
  • 所属期刊栏目 : 综述
  • 基金项目 :
  • 在线出版日期 : 2021-01-08
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