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染色质免疫沉淀分析技术(ChIP)条件的优化探索

摘要 : 目的:渴望建立一个适用于悬浮细胞的 ChIP 技术样本前处理条件的优化策略。方法:本研究利用 ChIP 技术在活细胞状态下固定蛋白质 -DNA 复合物,对固定复合物的交联剂甲醛浓度和超声断裂条件进行优化,期望得到 200~800bp 理想长度的染色体片段。结果:稀释 37% 的福尔马林溶液到终 浓度 1% 、交联作用时间控制在 15 分钟有较好的固定效果。超声裂解仪输出强度 6,功率 60%,脉冲次数 30 次,15 秒 / 次,超声脉冲的间歇时间为 1 分钟冰浴,总的超声处理时间应控制在 40 分钟内为得到理想长度片段的优选条件。

  • 作者 : 王亚婷 1 尚尔华 2 * 张正银 1 张保华 3 # 薛玉芹 1 王爱灵 1 高洪波 4
  • 作者单位 : 1 上海市浦东新区浦南医院检验科免疫分子诊断室 上海 200125;2 愛知東邦大学人間健康学部 日本名古屋 4658515;3 上海市浦东新区浦南医院妇产科 上海 200125;4 上海工程技术大学 上海 201620
  • 关键字 : 悬浮细胞、甲醛固定、超声裂解、交联
  • 刊名 : 东方医学与健康
  • 年,卷(期) : 2023 , 5
  • 所属期刊栏目 : 学术探讨
  • 基金项目 : 上海市浦东新区科技发展基金民生项目(基金号: PKJ2018-Y22);上海市浦东新区卫生系统领先人才培养实施计划(基 金号:PWRl2018-10);
  • 在线出版日期 : 2023-11-24
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