基于miRNA-mRNA探讨西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制及预后分析 - 湖南中医药大学学报

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—基于miRNA-mRNA探讨西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制及预后分析—

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摘要 : 目的基于miRNA-mRNA互作模式,明晰西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子机制并进行预后分析,为乳腺癌骨转移的药物干预靶点及生物标志物的确定提供理论依据。方法综合GEO、TCGA、TargetScan、GeneCards、OMIM、TCMSP、STRING、HPA数据库,采用R语言及Cytoscape软件对西黄丸干预乳腺癌骨转移的分子靶点进行miRNA-mRNA互作关系构建;蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)及Hub基因拓扑分析;基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。进一步使用TCGA数据库,分析肿瘤组织与正常组织分子靶点的差异表达,并通过HPA数据库进行免疫组化结果的相互佐证。最后结合患者临床信息,分析Lasso回归后分子靶点的预后相关性,单因素Cox回归分析临床信息与分子靶点预后情况,并开发乳腺癌骨转移的风险预测模型。结果西黄丸中的多种成分可作用于乳腺癌骨转移135个分子靶点,与196个乳腺癌骨转移差异miRNA构建出2964组miRNA-mRNA互作关系,锚定了10个Hub基因与95个miRNA,构建出175组miRNA-mRNA核心关系。Lasso回归聚焦出ADRB1是乳腺癌骨转移患者的独立预后因子,具有良好的诊断价值及生存预后价值,Cox回归分析发现乳腺癌的M分期、年龄是主要危险因素,而ADRB1高表达为保护因素,三者与患者总生存时间显著相关。基于8个miRNA(hsa-miR-500a-5p、hsa-miR-629-3p、hsa-miR-4665-5p、hsa-miR-3615、hsa-let-7d-5p、hsa-miR-93-3p、hsa-miR-141-3p、hsa-miR-

作者 : 邓显光刘丽芳袁博
作者单位 : 湖南中医药大学第一附属医院乳腺科湖南长沙410007
关键字 : 乳腺癌骨转移西黄丸生物信息学网络药理学列线图
刊名 : 湖南中医药大学学报
年，卷(期) : 2022 , 12
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在线出版日期 : 2023-03-23

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